New Mexico is een van de grootste producenten van chilipeper (Capsicum spp.) in de Verenigde Staten, met een productie van 51,000 ton in 2021 op een oppervlakte van 8500 hectare met een gemiddelde productiviteit van 6 ton/acres volgens het Amerikaanse ministerie van Landbouw National Dienst Landbouwstatistieken. De gemiddelde productiviteit daalde met 25% omdat het areaal voor de productie van chilipeper gelijk bleef. Dit resulteerde in een vermindering van de economische activiteit van bijna 10% in 2020 in vergelijking met het voorgaande jaar, van $ 50.1 miljoen naar $ 44.9 miljoen. Deze aanzienlijke daling van de totale productie van chilipeper in de staat spoorde wetenschappers aan tot nieuwe moderniseringsinspanningen gericht op het versnellen van de genetische winst en het verbeteren van de productiviteit in het NMSU Chile Pepper Breeding and Genetics-programma door verschillende eigenschappen met betrekking tot opbrengst en opbrengstpotentieel te evalueren met behulp van hoge- doorvoer fenotyperingstools zoals de Tomato Analyzer (TA).
Fruitarchitectuur en morfologiegerelateerde eigenschappen behoren tot de bepalende factoren voor de fruitdiversiteit en dragen in belangrijke mate bij aan de opbrengst en het opbrengstpotentieel van chilipeper. Met behulp van de TA-software verzamelden wetenschappers gegevens over een reeks fruitattributen, waaronder fruitomtrek, vormindexen, grootte en asymmetrie in een verzameling van verschillende chili-peperlijnen die werden geëvalueerd onder de groeiomstandigheden in New Mexico.
Onderzoekers probeerden 105 genotypen te karakteriseren van een Capsicum-diversiteitspanel bestaande uit cultivars, kweeklijnen, landras en wilde soorten behorend tot 12 verschillende soorten peul (fruit), voor 32 morfometrische TA-descriptoren. Hiërarchische clusteranalyse groepeerde de genotypen in acht clusters op basis van de TA-descriptoren. De basisafmetingen, namelijk omtrek, oppervlakte, breedte middenhoogte, maximale breedte, hoogte middenbreedte, maximale hoogteen gebogen hoogte waren de meest onderscheidende descriptoren met een maximale bijdrage aan de algehele vruchtvorm.
Het nut van de morfometrische TA-descriptoren, die moeilijk te meten zijn via conventionele fenotypering, werd aangetoond. Verschillende cultivars met de gewenste vruchtvorm en morfologie op basis van clusteranalyses werden aanbevolen als ouderlijnen voor hybridisatie om de opbrengst in veredelingsprogramma's voor chilipeper te verbeteren. Resultaten met behulp van de TA voor het meten van fruitgerelateerde kenmerken zullen hiervoor een basis vormen genoom-brede associatiestudie en genomische selectie voor opbrengst en opbrengstbevorderende eigenschappen in New Mexican chili pepper.